Кучу примеров нашел под линукс+qt+cubemx. Переделываю под винду, а cmake ругается
Я понял. У меня нет готового ответа для тебя, но у CMake есть описание про кросскомпиляцию здесь https://gitlab.kitware.com/cmake/community/wikis/doc/cmake/CrossCompiling
В частности
A toolchain for crosscompiling for Win32 using mingw32 might look like this
# the name of the target operating system
SET(CMAKE_SYSTEM_NAME Windows)
# which compilers to use for C and C++
SET(CMAKE_C_COMPILER i486-mingw32-gcc)
SET(CMAKE_CXX_COMPILER i486-mingw32-g++)
SET(CMAKE_RC_COMPILER i486-mingw32-windres)
# here is the target environment located
SET(CMAKE_FIND_ROOT_PATH /usr/i486-mingw32)
# adjust the default behaviour of the FIND_XXX() commands:
# search headers and libraries in the target environment, search
# programs in the host environment
set(CMAKE_FIND_ROOT_PATH_MODE_PROGRAM NEVER)
set(CMAKE_FIND_ROOT_PATH_MODE_LIBRARY ONLY)
set(CMAKE_FIND_ROOT_PATH_MODE_INCLUDE ONLY)
Там много и подробно написано, думаю, что должно помочь.