Ну, я просто не сталкивался пока с таким кейсом. Надо будет последить за поведением раскладки после спящего режима ...
на ЛОРе, ссылку не хочу сюда слать, тоже есть, кмк, верное и корректное объяснению этой вакханалии с двойными раскладками в гноме.
Баг заключается в неодинаковом поведении русской раскладки в Xorg и Wayland в Gnome. В Xorg’е, русская раскладка содержит только русские буквы, и поэтому должна использоваться только в комбинации с английской, которая содержит только английские. В Wayland’е на Gnome, при русской локали, русские буквы как-то автоматически через gnome-tweaks невидимо добавляются к английской раскладке, и переключение между ними по Alt+Shift. Поэтому при наличии как английской раскладки, так и русской, происходит переключение между английской (настоящей), русской (автодобавленной), и русской (настоящей) раскладками, что и приводит к иллюзии переключения со второго раза.
Но, как я понимаю, под словом "автодобавленной" и про wayland идет речь про уникод и UTF-8, хотя могу ошибаться.
Добавлю скрин, для корректности цитаты и авторства