обычно так и есть, типа тебе меняют должностную, не хочешь - иди гуляй
ну можно и не по соглашению уволиться, можно написать заевление на нарушение колективного договора, начальство по любому такое не подпишет и розводить бодягу. Даже если уволят по статье (а щас всем пофиг что у кого в трудовой написано) то ещё есть суд а там можно годик-другой им кровушку попить за запись в трудовую, пусть знают как гос деньги прожирать. В министерстве как раз нелюбят когда директор гос-организации не может нормально с людьми вопросы решать и могут со временем и его сменить.