Вот так:
Показать конфиг в терминале

/export compact


Сохранить конфигурацию в файл

/export compact file=myconfig


При этом конфигурация микротика сохраняется в понятном текстовом виде, вроде

/interface bridge
add name=bridge1
/interface ethernet
set 0 comment=To-ADSL-Modem mtu=1480 name=WAN
set 1 comment=To-LAN-Switch name=LAN
set 2 master-port=LAN
set 3 master-port=LAN
set 4 master-port=LAN
и т.д.